結合高新區的相關經驗及主要問題，綜合考慮當前經濟發展的整體環境和資本市場實際運行情況，對資本市場發揮市場資源配置功能、強化資本和科技融合、支持供給側結構性改革等方面提出以下建議。
第一，積極促進資本形成、集聚和流轉。應大力促進企業與多層次資本市場對接，為企業打造全流程資本市場服務體系。一是完善“新三板”的制度建設與運行機制。鑒于現行“新三板”制度供給與市場容量不匹配等現狀，建議重點解決存量掛牌企業結構性、流動性問題及增量企業入場問題。首先厘清市場分層和市場定位，明確市場層次差異，構建差異化制度供給體系；其次適當降低投資者適當性標準，引入更多合格個人投資者，鼓勵公募基金、企業年金等長期機構投資者進入“新三板”市場，著力解決流動性問題。可考慮創新層在現有交易制度基礎上，引入競價交易，實行混合交易制度。在創新層制度實施的基礎上，研究并適時引入轉板機制。二是加強區域性股權交易市場建設。應進一步明確區域性股權交易市場定位，在規范統一監管的同時，鼓勵不同區域交易所的差異化競爭與協作。明確在區域性股權市場掛牌的企業轉到“新三板”市場的具體操作細節。通過引入投資銀行、融資擔保機構、信用評級機構等中介機構，完善企業進行多種直接融資和股權交易的制度配套。加強區域性股權市場與特色產業園地、政府引導基金的對接，促進雙創戰略落地。
第二，為中小企業提供全方位多渠道融資支持。由于銀行具有順經濟周期特點，在經濟下行周期對中小企業放貸審批更加嚴格，同時鑒于高新區企業風險大、輕資產等特點，應進一步完善銀行、證券、保險、財政等機構合作，建立多方共擔風險機制，發揮資金的增信效應和放大效應。一方面，促進股權投資機構與各類債權金融機構合作，通過信息共享、風險分擔等方式，為處于不同發展階段的企業提供投貸聯動融資支持。另一方面，加強保險機構對申請創業企業承保風險的調查、評估及審核；加快發展科技保險以及信用保證保險，化解科技創新和產業升級風險，推進融資模式和征信機制創新。同時，發揮好財政資金的“杠桿”和“引子”作用，充分利用市場化手段實現對政府基金的撬動和引導，擴大有效資本供給。
第三，提升私募股權投資基金的投融資能力。為促進私募股權投資基金對雙創企業的支持，應盡快出臺公平、統一的私募股權投資基金稅收優惠政策，在稅收方面給予優惠。在風險可控的前提下，逐步提高全國社會保障基金投資創業投資基金、股權投資基金和產業投資基金比例，支持全國社會保障基金投資私募證券投資基金，進一步研究完善保險資金投資私募證券投資基金的政策。支持設立創業投資引導基金，引導創業投資基金和天使投資人增加對創業早期企業的投資，積極培育各類早期創業投資主體。
第四，發揮中介機構在推動創新企業發展中的作用。相比一般創新企業，投資銀行不論是對市場信息和資本等要素資源的掌握，還是對市場交易規則的理解和運用技能方面，都具有較強的專業優勢。引入并發揮好投資銀行的作用，對于推動創新企業的融資、資源整合、并購重組、轉型發展，甚至進入國際市場等都具有積極作用。對于高新區來說，引入投資銀行后，既能使現有創新企業獲得更大助力，還能吸引更多創新企業入駐。因此，應進一步發揮投資銀行在推動創新企業發展中的作用。