2016年可謂是我國資本市場的監管年，成長中的新三板市場更是進入嚴格監管期。統計數據顯示，2016年新三板市場非標審計意見占比較上年增長1.05倍，A股市場近三年以來非標審計意見占比基本平穩。根據choice數據統計，截至5月15日，共有151家掛牌公司2016年年報被審計機構出具非標意見。雖然非標意見審計報告高達151份，但占已披露的10626份審計報告的比重僅為1.42%。
綜合股轉系統及choice數據，截至2016年6月30日，共有6938家掛牌公司披露2015年年報，其中48份財報被審計機構出具非標審計意見，占當年年度審計報告比0.69%。(注：因2014年新三板市場尚處發展初期，故未納入比較范圍)
另外，在2016年年報審計報告中，新三板市場共有22份非無保留審計意見報告，較2015年年報中的15份非無保留審計意見報告增長46.66%。值得注意的是，與非標審計意見相比，非無保留審計意見嚴重程度更高。非無保留審計意見包含保留意見，否定意見及無法表示意見。帶強調事項段無保留意見屬于無保留意見，但因存在需要說明的事項，所以在審計報告中添加強調事項段，提醒報表使用者注意。
然而，A股市場卻是另一番景象。近三年以來，A股非標審計意見報告占報告總數比重保持在3.67%至3.35%之間，雖略有下降但基本保持穩定。根據中注協數據統計，截至4月30日，A股市場共有105份2016年年報非標審計報告，占當年3136份審計報告總數量比重為3.35%。
由于2016年下半年IPO審核提速，A股2016年度審計報告數量較2015年同期增長294份，但其中非標意見審計報告105份，僅較上年同期僅增長1份。非標意見審計報告占當年告總數量比重從3.66%降至3.35%。
此外，2016年度A股市場共有30份非無保留意見審計報告，是同期新三板市場的1.36倍，較A股市場上年同期同樣增長1.36倍。也就是說，雖然非標審計意比重有所下降，但從嚴重程度更高的非無保留審計意見分析，A股市場2016年度非無保留意見審計報告數量較上年同期增加36%，且高于同期的新三板市場。