據統計，截至2017年4月28日，新三板共計11113家公司需要披露2016年年度報告，其中，10554家已完成披露工作，559家公司未能按期披露年度報告，其中包括創新層和基礎層企業。根據相關規定全國股轉系統決定自2017年5月2日起暫停未按期披露年報公司的股票轉讓。
根據分層管理辦法，每年5月份最后一個交易周的首個轉讓日調整掛牌公司所屬層級（進入創新層不滿6個月的掛牌公司不進行層級調整）。基礎層的掛牌公司，符合創新層條件的，調整進入創新層；不符合創新層維持條件的則調整進入基礎層。另外，創新層企業需按時編制并披露年度報告。這意味著除了被強制暫停轉讓之外，上述559家企業也將無緣進入創新層。
《證券日報》采訪的多位券商人士認為，自2016年新三板實施分層以后，監管層不斷加強監管，相關制度供給尤其是針對創新層的制度供給仍未陸續出臺，在今年強化監管的基礎上，預計今年第四季度或將有創新層制度供給出臺，因此今年5月份的首次調層尤其吸引企業注意。
東北證券新三板研究中心總監付立春認為，今年將是新三板出臺政策紅利的“大年”，預計大宗交易將推出，甚至有可能推出集合競價等紅利政策，監管層也可能會在創新層基礎之上再設立精選層。
據聯訊證券新三板研究院根據年報篩選統計，除上述559家企業以外，目前已有957家尚在基礎層的企業符合新進創新層的分層標準。另外，在現有創新層企業中，按照分層管理辦法，一旦業績、合格投資者人數、流動性方面不合格，依然會被剔除創新層，目前已有530家企業符合繼續維持在創新層的分層標準。